Примерно раз в полгода я запускаю в консоли pear и лезу в хелп или гуглю нужные команды (хорошо если натыкаюсь на http://pear.php.net/manual/en/guide.users.commandline.commands.php или на http://pear.php.net/manual/en/guide.users.commandline.channels.php)

Итак. На примере обновления PHPUnit до версии 3.6.0RC4.

1. Просмотр списка каналов
$ pear list-channels

2. Просмотр всех доступных пакетов с определенного канала
$ pear list-all -c pear.phpunit.de

3. Обновить все пакеты
$ sudo pear upgrade-all

4. Разрешаем установку бета версий
$ sudo pear config-set preferred_state beta

5. Обновиться до определенной версии пакета
$ sudo pear upgrade phpunit/PHPUnit-3.6.0RC4

6. Посмотреть список установленных пакетов
$ pear list -a

Пока все 🙂

PS. Разгребаю черновики записей в блоге